Pembelajaran di KPB dibagi tiga tahap, kelas 10, 11, 12. Setiap tahap memiliki dua paket program, semester pertama dan semester kedua. Masing-masing memiliki proyek utama dan proyek pendukung.

Tahap K10 di semester pertama dengan program bernuansa transisi, proyek utamanya berorientasi pada kolektivitas. Di semester kedua dengan nuansa adaptasi, proyek utamanya berorientasi pada komunitas.

Tahap K11 di semester pertama dengan program bernuansa ekspresi, proyek utamanya berorientasi pada individualitas. Di semester kedua dengan nuansa eksplorasi, proyek utamanya berorientasi pada penjelajahan.

Tahap K12 di semester pertama dengan program bernuansa kolaborasi, proyek utamanya berorientasi pada magang. Di semester kedua dengan nuansa determinasi, proyek utamanya berorientasi pada penyusunan my life plan.