Lantai kedua bunker, bunker ini memiliki total puluhan level bawah tanah, kebanyakannya berfungsi individual, dari fasilitas kesehatan, penelitian, arsip, sentral komunikasi dan gudang penyimpanan senjata dan kendaraan, tim yang ditempati Samuel dan Sierra terakhir mendatangi fasilitas penelitian dan kesehatan bunker, terakhir dimana seluruh tim hilang. Untuk mencapai area fasilitas penelitian dan kesehatan, sebelum memasuki level fasilitas kesehatan dan penelitian, beberapa level bunker sebelum harus diakses satu persatu, seluruh bunker masih dalam kondisi “lockdown”, sehingga beberapa tangga darurat harus diakses menggunakan “keycard”. Samuel dan Sierra dengan intel yang ada, untungnya sebelum pelaksanaan misi ini, semua anggota melakukan sesi “briefing”, sehingga semua intel yang diperlukan sudah terdengar, semua anggota tim mempunyai setidaknya 1 cetakan kartu akses bunker, sisanya hanya dilengkapi dengan alat pembuka kunci elektronik.
Mengakses lantai kedua, yaitu fasilitas pengarsipan data dan informasi elektronik, seluruh lantai dibagi ke empat area, ada ruangan arsip elektronik esensial, dan data elektronik rahasia, sama seperti pengarsipan data fisik. Samuel dan Sierra bergegas memasuki area penyimpanan data elektronik esensial, karena data untuk kunci akses dan denah seluruh area terdapat di dalam tempat tersebut, sayangnya dalam misi ini, Samuel dan Sierra terpisah, diakibatkan oleh kedatangan pasukan musuh yang mendadak, total 20 pasukan musuh, Samuel terjebak dan tertangkap setelah 2 jam terjadinya sebuah “assault”, Samuel ditangkap, ia disergap oleh pasukan musuh dari belakang, kepalanya terpukul dengan belakang senjata musuh, pukulannya sangat keras, sehingga membuat Samuel pingsan.
Untungnya untuk Sierra, rekan dari Samuel, ia berhasil mendapatkan data elektronik, menyusup tanpa tertangkap atau disadari oleh pasukan musuh, karena itu Sierra dapat mengakses semua foto dan rekaman untuk dikirim ke pusat, sebagai bukti kegagalan misi demi memanggil bantuan dari pusat, membawa pasukan utama Corvelas. Seluruh personil tentara Ukraine terdorong oleh pasukan musuh, sehingga tidak dapat membantu personil Corvelas, dikarenakan sebuah “assault” besar-besaran di area kapital Pripyat.